การรวมตัวของสายพันธุ์ต่างชนิดกัน การประกอบที่ผิดพลาดเหล่านี้คุกคามจุดประสงค์ของการจัดลำดับเมทาจีโนม ซึ่งก็คือการศึกษากลุ่มยีนอย่างครอบคลุม โดยการสร้างจีโนมแบบร่างหลายชุดในตัวอย่างที่กำหนด ปัญหานี้ซับซ้อนยิ่งขึ้นจากการมีอยู่ของสิ่งมีชีวิตบางชนิดในตัวอย่างเหล่านี้ซึ่งไม่สามารถเพาะเลี้ยงโดยใช้เทคนิคทางจุลชีววิทยามาตรฐานได้

นักวิทยาศาสตร์จากโตเกียวเทคมีคำตอบแล้ว พวกเขาได้พัฒนาเมตาจีโนมแอสเซมเบลอร์แบบใหม่ที่เรียกว่า MetaPlatanus ซึ่งสามารถสร้างลำดับดีเอ็นเอที่แม่นยำ รวมถึงลำดับของสิ่งมีชีวิตที่ไม่ได้รับการเพาะเลี้ยง การอ่านลำดับ DNA แบบสั้นที่แม่นยำเพื่อรวบรวมส่วนต่อประสาน Contigs เป็นลำดับดีเอ็นเอที่ยาวกว่าเล็กน้อยซึ่งคล้ายคลึงกับชิ้นส่วนจิ๊กซอว์ในจีโนมที่ใหญ่กว่า contigs ถูกประกอบเป็นโครงขนาดโครโมโซมที่ใหญ่ขึ้นโดยใช้อินพุตซ้ำๆ เช่น การเชื่อมโยงลำดับระยะยาว องค์ประกอบลำดับเฉพาะของสปีชีส์ ความลึกของการครอบคลุม และข้อมูลการเชื่อมโยง วิธีการประกอบเมตาจีโนมแบบไฮบริดที่ ไม่เพียงแต่ใช้ประโยชน์จากข้อดีของการอ่านลำดับทั้งระยะสั้นและระยะยาว แต่ยังชดเชยข้อบกพร่องที่เกิดจากความยาวการอ่านอย่างใดอย่างหนึ่งและตัวตัวอย่างเองด้วย